| 农学院 | 级 别 | 名 称 | 项目负责人 |
| 国家级 | 作物抗逆与高效生产全国重点实验室 | 康振生 | |
| 国家杨凌农业生物技术育种中心 | 李停栋 | ||
| 省部级 |
国家小麦改良中心杨凌分中心 | 吉万全 | |
| 国家玉米改良中心杨凌分中心 | 薛吉全 | ||
| 小麦育种教育部工程研究中心 | 李学军 | ||
| 农业农村部西北黄土高原作物生理生态与耕作重点实验室 | 任小龙 | ||
| 农业农村部西北地区小麦生物学与遗传育种重点实验室 | 奚亚军 | ||
| 农业农村部西北旱区玉米生物学与遗传育种重点实验室 | 薛吉全 | ||
| 农业农村部作物基因资源与种质创制陕西科学观测试验站 | 吉万全 | ||
| 陕西省植物遗传工程育种重点实验室 | 陈新宏 | ||
| 陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室 | 陈明训 | ||
| 陕西省循环农业工程技术研究中心 | 冯永忠 | ||
| 陕西小麦工程技术研究中心 | 高翔 | ||
| 陕西省小麦新品种培育工程研究中心 | 高翔 | ||
| 陕西省玉米工程技术研究中心 | 薛吉全 | ||
| 农业废弃物资源化利用技术共享服务平台 | 冯永忠 | ||
| 校级 | 作物生物学创新中心 | ||
| 小宗粮豆研究中心 | 冯佰利 | ||
| 油菜研究中心 | 胡胜武 |
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| 作物栽培研究所 | 贾志宽 | ||
| 小麦研究中心 | 吉万全 |
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