信息工程学院李富义教授课题组在RNA编辑预测研究上取得新进展

近日，我院智能计算与农业信息系统学科团队李富义教授课题组在西北农林科技大学G2类期刊《Briefings in Bioinformatics》（数学与计算生物学Top期刊，2022年影响因子为13.994）上发表题为“ATTIC is an integrated approach for predicting A-to-I RNA editing sites in three species”的最新研究成果。西北农林科技大学信息工程学院为该论文第一作者单位，李富义教授为通信作者和共同第一作者，课题组助研陈如意（现博士就读于澳大利亚昆士兰大学）为论文共同第一作者。

为准确识别A-to-I RNA编辑位点，提高对其在转录修饰中作用的理解，该论文提出了一种新的基于堆叠的预测器—ATTIC，能够准确预测多个物种中的A-to-I RNA编辑位点，同时开发了免费在线预测平台。该研究结合14种主流的机器学习算法，综合评估了37种RNA序列特征，并提出了一种自适应特征选择算法来优化分类器的特征空间，利用堆叠法构建集成学习模型提升模型的鲁棒性和泛化性。实验表明，ATTIC在预测A-to-I编辑位点方面优于现有方法。这项研究成果为物种特异性的A-to-I RNA编辑位点预测提供了准确的算法模型，揭示了RNA编辑位点的上下文的物种特异性特征。

该研究得到了国家自然科学基金（62202388）、国家重点研发计划（2022YFF1000104）、秦创原引用高层次创新创业人才项目（QCYRCXM-2022-230）和西北农林科技大学人才科研经费等项目的资助。

论文链接：https://academic.oup.com/bib/article/24/3/bbad170/7153800?searchresult=1